Revista Digital Universitaria
ISSN: 1607 - 6079 Publicación mensual
 
1 de marzo de 2010 Vol.11, No.3
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El impacto del Supercómputo en la química cuántica
Jorge Garza Olguín
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Introducción El método... La necesidad...

Computadora o...

El hardware... Nuevas técnicas... Conclusiones y Bibliografía

Nuevas técnicas de programación

La actual tecnología demanda programar con otra filosofía a la programación serial. De hecho es ahora común que un programa de química cuántica computacional esté basado en MPI (message passing interface, interface de paso de mensaje) el cual ha sido un estandar de programación desde 1993.14 ¿Cuánto se puede ganar al programar en paralelo? En principio, un programa diseñado para correr en paralelo debe de ejecutar tareas en menor tiempo cuando se usan más procesadores. Pero no sólo eso, también el ejecutar un programa en paralelo significa que se puede incrementar la memoria RAM en la medida de que se usen varios procesadores en esa ejecución. Ya hemos mencionado a la -ciclodextrina, la cual ha sido estudiada usando 1806 funciones de base. En este momento usando códigos diseñados para correr en paralelo, como el NWChem,15 es factible obtener los mínimos de este sistema en la superficie de energía potencial. Lo cual permite predecir las conformaciones espaciales que puede adoptar esta molécula. Con el arribo de los GPUs será necesario tener un estandar de programación, como el MPI, ya que en este momento hay dos propuestas claras que son independientes una de otra.16

14. Sitio de web http://www.mcs.anl.gov/research/projects/mpi.
15. Sitio de web http://www.emsl.pnl.gov/capabilities/computing/nwchem
16. Kirk, D. B. y Hwu, W. W. Programming massively parallel processors. A hands-on approach. Morgan Kaufmann y Elsevier, 2010.


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